Bayesian Data Analysis in Ecology Using Linear Models with R, BUGS and Stan
Fränzi Korner-Nievergelt, Tobias Roth, Stefanie von Felten, Jérôme Guélat, Bettina Almasi, Pius Korner-Nievergelt.
Elsevier, New York, 2015
Hier stellen wir Ihnen den vollständigen R-, BUGS- und Stan-Code sowie zusätzliche Informationen und Übungen zur Verfügung (auf Englisch). Wir können das vollständige Buch nicht zur Verfügung stellen. Kaufen kann man es bei Elsevir. Shop
Alle Datendateien und einige Zusatzfunktionen sind im R-Paket blmeco auf CRAN veröffentlicht. CRAN
Chapter 2: Prerequisites and Vocabulary
Chapter 3: The Bayesian and the Frequentist Ways of Analyzing Data
Chapter 4: Normal Linear Models
Chapter 5: Likelihood
Chapter 6: Assessing Model Assumptions
Chapter 7: Linear Mixed Effects Models
Chapter 9: Generalized Linear Mixed Models
Chapter 10: Posterior Predictive Model Checking and Proportion of Explained Variance
Chapter 11: Model Selection and Multimodel Inference
Chapter 12: Markov Chain Monte Carlo Simulation
Chapter 13: Modeling Spatial Data Using GLMM
Chapter 14: Advanced Ecological Models
- R-code 14.1: Hierarchical multinomial model to analyse habitat selection using BUGS
- R-code 14.2: Zero-inflated Poisson mixed model for analysing breeding success using STAN
- R-code 14.3: Occupancy model to measure species distribution using STAN
- R-code 14.4: Territory occupancy model to estimate survival using BUGS
- R-code 14.5: Fledgling Survival of Barn Swallows Using Cormack-Jolly-Seber model in Stan
Chapter 15: Prior Influence and Parameter Estimability
- R-code
BUGS files:
STAN files: